北京大学肿瘤医院胃肠肿瘤中心二病区拥有的胃肠肿瘤诊疗和研究团队，比肩国际胃肠诊疗中心。共开放床位29张，专长于进展期胃肠肿瘤的手术和综合、早期胃癌的保留功能手术、低位直肠保肛手术等。主治病种包括胃癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤和其他少见胃肠道肿瘤。在多学科讨论的基础上，为每一位患者制定和实施为合理的诊疗规划。在中心主任季加孚院长的直接领导下，科室秉承北京大学肿瘤医院的优良传统，追求，不断进步，在临床、科研、教学等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持稳健、严谨工作作风的同时，走上了高速发展的快车道。科室人员结构：1、人员构成：主任医师3人，副主任医师6人，主治医师7人，住院医师2人，护理人员17人。2. 科室主要领导：胃肠肿瘤中心主任季加孚，科主任步召德，护士长赵旻。
科室特色包括：微创手术、外科、疑难手术、功能保留手术、快速康复、病人全程管理。
北京大学肿瘤医院肝胆胰外一科创建于1996年。现有病床33张，医师10人，其中正高职称医生2人，副高职称1人，中级职称4人，在读研究生4人，所有医生均为研究生毕业。建科以来，在黄信孚及邢宝才主任的领导下，科室全体医师秉承以"延长病人生存，改善病人生活质量，为病人解除病痛"为目标，把肝胆胰肿瘤综合的理念与肝胆胰外科手术的近技术相结合，不断创新，不断提高，不断完善，形成了鲜明的本科室的诊疗特色。在医疗、科研和教学方面居国内水平。同时，培养出了一大批研究生和青年医师。
现任主任邢宝才，教授，主任医师。担任：中国协会肝癌专业委员会常委，中华外科学会肝脏外科学组委员，中华肿瘤学会肝癌学组委员，中国协会大肠癌肝转移学组委员，中国协会胆道肿瘤委员会常委，中国协会胰腺癌委员会委员，卫生部肿瘤规范化专家委员会委员，北京协会理事，北京协会肝胆胰肿瘤委员会主任委员，北京肿瘤学会委员，北京大学肝癌中心副主任，北方肝癌专家委员会副主任。同时担任多种杂志的编委和审稿专家。
乳腺肿瘤内科是以进展期乳腺癌诊治为主的专科临床科室，现有主任医师3名，副主任医师1名，主治医师5名，住院医师2名，临床护士20名，开放床位33张。科室以乳腺癌综合为重点，包括化疗、内分泌、靶向等，强调规范化基础上的个体化，尤其对于复发转移性乳腺癌的更有丰富的经验和独到的见解，诊治水平在国内享有盛誉，是NCCN乳腺癌指南中国版内科部分执笔人之一，主持和参与多项国内外临床试验。乳腺肿瘤内科近5年主持或参与完成了多项国家自然科学基金、国家973项目分课题、北京市新世纪百千万人才工程、首都医学发展科研基金、教育部高等学校博士学科点专项科研基金、北京市卫生系统高层次人才培养计划、国家“十二五”重大专项课题。发表文章百余篇，其中SCI文章三十余篇。
北京大学肿瘤医院淋巴瘤科是我国成立早的淋巴瘤专业科室，经历了36年的发展历程，已经成为我院的特色品牌科室之一，目前拥有普通病床36张，移植舱位4张，专业从事淋巴瘤的临床诊断与、以及自体干细胞移植。收治患者全部为各类型淋巴瘤患者，几乎涵盖世界卫生组织淋巴瘤分类的全部亚型。
我科现有临床医生12人，其中正副主任医师7人、主治医师4人、住院医师1人;护士20人，专业科研人员和技术员各1人，科研护士2人。每年门诊接诊4000人次，新收治住院淋巴瘤患者400例，每月出院患者约200人次。
为了给患者提供更好的个体化综合诊治平台，2005年，以淋巴瘤科为主成立了院内淋巴瘤专业协作组，包括淋巴瘤内科、病理科、外科、放疗科、影像科、核医学科等等，对疑难病例进行全院会诊讨论。
在繁忙的日常工作之外，为了提高淋巴瘤的水平，促进学科发展，也为了给患者提供更多的机会和措施，我科先后承担了30余项国内外新药临床研究。同时作为医院品牌科室和国内少数淋巴瘤专业科室之一，承担了大量北京及外省市疑难病例会诊工作和学术讲座;承担北京大学医学部硕士、博士研究生及住院医师、进修医师、访问学者的部分培训工作;定期为患者及家人举办康复课堂教育活动等等。
感谢患者及家人的支持和理解，也感谢国内外同道的关注和鼓励，淋巴瘤科将继续秉承我院“院有品牌、科有特色、人有专长”的办院宗旨，为来自国内外的淋巴瘤患者提供优质规范的医疗服务和人性化的关怀照顾。