性质不同：保函是一种担保文件，担保人承担的是第二性的付款责任，即只有在委托人不履行义务时，担保人才承担付款责任；而信用证是一种银行信用，开证行承担性的付款责任，只要受益人提交的单据符合信用证要求，开证行就必须付款。
应用范围不同：保函的应用范围较为广泛，除了用于国际贸易，还常用于工程承包、投标、租赁等领域；信用证主要用于国际贸易结算，特别是在货物买卖中，用于保证买卖双方的货款支付和货物交付。
单据要求不同：保函索赔时，受益人通常需要提交证明委托人违约的文件等；信用证则主要依据受益人提交的符合信用证条款的商业单据等进行付款，对单据的要求更为严格和具体。
其他条款
法律适用：明确该保函适用的法律，通常选择与基础合同相同的法律，以便在出现纠纷时能够依据明确的法律规定进行处理。
争议解决：约定如双方在保函的履行过程中发生争议，采用何种方式解决，如协商、调解、仲裁或诉讼，并明确具体的仲裁机构或管辖法院。
保函的修改与撤销：说明保函是否可以修改以及在何种条件下可以修改，一般要求经各方协商一致并签署书面协议方可修改。同时，也会规定保函撤销的条件和程序。
保函类型涵盖广泛：包括投标保函、履约保函、预付款保函、质量保函、农民工工资保证金保函、诉讼保函、解封保函等。